The Cancer Genome Atlas,是由National Cancer Institute ( NCI, 美国国家癌症研究所) 和 National Human Genome Research Institute (NHGRI, 国家人类基因组研究所) 合作建立的癌症研究项目,通过收集整理癌症相关的各种组学数据提供了一个大型的,免费的癌症研究参考数据库。
TCGA数据挖掘文章分析内容:
确定分析疾病
数据下载及处理
差异分析并筛选
富集分析:GO、Pathway、GSEA富集分析
生存分析,ROC曲线分析
高级分析: WGCNA、ceRNA分析