全转录组是指特定组织或细胞在特定状态下转录出的所有转录本信息的总和,包含mRNA,small RNA,lncRNA,circRNA等编码和非编码RNA,可以同时获得更多转录数据信息。
近年来,除了魅力不减当年的miRNA、炙手可热的lncRNA、circRNA外,ceRNA分析作为新的基因表达调控模式,ceRNA假说揭示了一种RNA间相互作用的新机制也开始崭露头角,基因组的暗物质逐渐被揭开,成为科研界的耀眼明星。
全转录组测序方案
1、 建库测序:
① sRNA library+rRNA removal library
② sRNA library+rRNA removal library+circRNA library
2、 分析内容:
Heatmap & volcano plot
KEGG & GO enrichment
ceRNA network