甲基化技术介绍

基因组DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰系统，在调控基因表达、细胞分化以及其它各种生命过程中起到了非常重要的作用。

5mC是DNA甲基化重要的一种修饰，广泛存在于植物、动物等真核生物，被誉为“第五碱基”。

5hmC是新发现的一种修饰碱基 。

这些化学修饰中，研究得最透彻的是 5-甲基胞嘧啶 (5mC)，该修饰被通常认为是基因表达的一种稳定的抑制性调控因子。人类基因组含有大约 1% 的甲基化胞嘧啶，因此其是最丰富、最广泛的 DNA 修饰。

全基因组甲基化测序（WGBS）

·      单碱基分辨率

·      全基因组

·      适合所有有参物种（动植物）

·      适合各种类型样本（细胞、组织、cfDNA、 FFPE等）

·      测序30X以上

简化基因组甲基化测序（RRBS）

·      单碱基分辨率

·      全基因组范围

·      富集启动子/CpG岛甲基化调控区域

·      适合人和哺乳动物、动物及鱼类

·      适合细胞、全血及新鲜冷冻组织

目标区域甲基化测序(Targeted Bisulfite Sequencing)

·         单碱基分辨率

·         针对目标序列，非常灵活

·         适合多种样本类型

·         应用方向：450K/850K芯片筛选的差异甲基化CpG位点(DMS)

焦磷酸测序

·         得到定量序列结果的技术   

·         极高的准确性

·         重现性好

·         实验设计灵活

DNA甲基化芯片-850K

·         全面的基因组覆盖范围：检测>853,000个CpG位点，全面覆盖CpG岛、启动子、编码区、开放染色质和增强子。此外还包括CpG岛外的CpG位点，已知DMR位点，脱氧核糖核酸酶超敏位点以及miRNA启动子区域。

·         高质量的数据：同时采用Infinium I及II探针设计，使检测范围最大化。

·         分辨率高：单碱基分辨率，可以直接检测到发生甲基化的确切位点。

·         可重复性高： 自身技术重复相关性R2 > 0.98；与450K交集探针间相关性R2 > 0.98。

·         起始模板量低：仅需 250ng，大大节约了样品量。